Aburame Klanı
Bu klana mensup kişiler böcekleri çakra ile kontrol edebilirler. Bunu için ormanlık bölgelerde böcek avına çıkmalı ve birkaç böcek yakalamalıdırlar. Ardından bunlar ile çakra bağı oluşturup kontrol edebilirler. Bu klan için üye alımı sınırsızdır. Geninken 20 böcek , Chuunin iken 40 böcek , Jounin iken 80 böcek , bunların üstünde ranklar için 150 böcek kullanabilirler.
Akimichi Klanı
Bu klana mensup kişiler belirli jutsular ile vücutlarını büyütebilirler. Klan üyeleri üç farklı hap ile yeteneklerini geliştirebilirler. Bu klana üye kişiler genelde şişman olurlar. Klana üye alımı sınırsızdır.
Hyuuga Klanı
Bu klana mensup kişilerin bir göz tekniği bulunmaktadır. Bu tekniğe byakugan denmektedir. Bu teknik ile rakibinizin çakra noktalarını görebilirsiniz. Byakuganı nasıl aktive edeceğinizi öğrenmek için klan jutsuları bölümüne bakabilirsiniz. Klan için üye alım sayısı 4tür.
Inuzuka Klanı
Bu klana üye kişiler köpekler ile bir bağ kurmuşlardır. Kullanıcı oyuna başladığı zaman ona küçük bir köpek verilir ve bu köpek ile çeşitli teknikler uygulayabilirler. Bilgi için klan jutsularına bakınız. Klana üye alımı sınırsızdır.
Nara Klanı
Bu klanın üyeleri gölge kontrolü tekniklerini uygulayabilirler. Klan üyelerinin özel teknikleri için klan jutsularına bakabilirsiniz. Klan için üye alımı 5tir.
Uchiha Klanı
Bu klan Konoha'nın en saygı duyulan klanlarındandır. Çok köklü bir klandır. Bu klanın üyeleri Sharingan adlı bir tekniğe sahiplerdir. Sharingan için klan jutsularına bakınız. Klan kontenjanı 2dir. Ayrıca klana girerseniz elementiniz katon olacaktır.
Yamanaka Klanı
Bu klanın üyeleri genelde sarı saçlı mavi gözlüdür. Teknikleri ise kendi ruhunu başka birinin bedenine aktarabilmedir. Klan için kontenjan sınırsızdır.
Kaguya Klanı
Bu klana mensup kişilerin beş farklı dans formu bulunur. Özel yetenekleri ise kendi kemiklerini silah olarak kullanabilmektir. Klan kontenjanı 3tür. Klan üyelerinin çıkardığı kemiklerin kırılması çok zordur. Ayrıca vücudunda kırılan kemikler hızlıca iyileşebilir.